Атрофия кишечника не является особо серьезным заболеванием. Считается, что она вызывается психическими или эндокринными факторами, которые приводят к атрофии желез слизистой оболочки кишечника человека, включая атрофию кишечных ворсинок, что приводит к дисфункции кишечника. Основными клиническими проявлениями являются дегенерация желудочно-кишечного тракта, нарушения всасывания, а при длительном течении заболевания — анемия, истощение и недоедание. Атрофия ворсинок кишечного тракта также является проявлением синдрома рака желудочно-кишечного тракта, что должно насторожить. Основными проявлениями являются гипопротеинемия и увеличение отека, что приводит к диарее, потере воды, электролитным нарушениям и, в тяжелых случаях, к шоку.