Существует множество причин анальной утечки, в основном это различные причины нарушения анального вегетативного контроля и неспособности контролировать стул по желанию. Основными причинами являются: во-первых, повреждение аноректального кольца, например, при аноректальной операции, если аноректальное кольцо отрезано, это приводит к потере функции анального сфинктера, что приводит к расслаблению сфинктера, приводящему к анальной утечке кала. Во-вторых, при длительном сильном выпадении или выпадении внутренних геморроидальных узлов, это вызовет усталость мышц анального сфинктера, что приведет к его расслаблению, а плохое закрытие анального отверстия во время дефекации приведет к анальному подтеканию кала. В-третьих, анальная хирургия, если из анального канала удаляется слишком много кожи и окружающих тканей, образование более глубоких рубцов также приведет к неполному закрытию анального отверстия. В-четвертых, повреждение центральной нервной системы, спинномозговых нервов или нервов промежности может привести к тому, что нервы, иннервирующие анус, утратят свою нормальную функцию, в результате чего анальный сфинктер не сможет произвольно сокращаться и расслабляться, что вызовет анальную утечку.