Амниоцентез стоит дороже, чем неинвазивный тест ДНК, который сейчас стоит дешевле и может быть проведен примерно за 1000 долларов. Однако при проведении неинвазивного ДНК-теста при наличии отклонений необходимо провести амниоцентез. Поскольку неинвазивный тест ДНК все еще подвержен определенным ошибкам, его нельзя использовать в качестве окончательного диагноза или критерия для прерывания беременности. Поэтому, если существует риск аномального развития плода, амниоцентез может быть проведен напрямую. С амниоцентезом связаны некоторые риски, но технология в нашей стране сейчас более совершенна, и риски очень минимальны.