И медроксипрогестерона ацетат, и прогестерон обладают по сути тем же действием, что и прогестерон, но иногда существуют различия в способах применения этих двух препаратов и заболеваниях, которые они лечат. Медроксипрогестерона ацетат не используется для лечения нерегулярных менструаций в период полового созревания, поскольку при его метаболизме образуются андрогены, которые не полезны для девочек пубертатного возраста и лучше использовать для регуляции менструаций у женщин детородного возраста. Прогестерон — это натуральный прогестаген, но побочные эффекты этого препарата более выражены при пероральном приеме и могут вызывать головокружение, сонливость и усталость. Как правило, он более эффективен и стабилен при использовании для регуляции менструаций путем внутримышечных инъекций.