Ранних симптомов хронического пиелонефрита не существует. Пациенты с хроническим пиелонефритом могут проявляться неясной болью в пояснице, периодической частотой мочеиспускания и лихорадкой низкой степени. Хронический пиелонефрит протекает сложнее, системные и местные проявления в моче нетипичны, а иногда проявляется только бессимптомная бактериурия. Более чем у половины пациентов в анамнезе может быть острый пиелонефрит, сопровождающийся лихорадкой с низкой температурой, периодическим учащением мочеиспускания, дискомфортом при мочеиспускании, болями в поясничной области и нарушением функции почечных канальцев, например ноктурией, гипогранулонефрозом и т. д. Заболевание может прогрессировать до хронического пиелонефрита. При персистировании заболевания может развиться хроническая почечная недостаточность. Во время острых приступов у пациента проявляются симптомы, схожие с острым пиелонефритом. Пациентам с хроническим пиелонефритом рекомендуется обратиться в обычную больницу и получить стандартное лечение под руководством врача.