Перед колоноскопией необходима подготовка желудочно-кишечного тракта, то есть прием слабительных средств внутрь для опорожнения кишечного тракта, обычно в качестве слабительного используются полиэтиленгликолевые дисперсии электролитов, только после опорожнения кишечного тракта можно проводить колоноскопию, чтобы четко видеть внутреннюю ситуацию в кишечнике, чтобы избежать неправильного диагноза и пропусков. После приема слабительного появятся симптомы диареи, от начала выделения по типу стула, до выделения прозрачного водоподобного стула, чтобы подготовить кишечный тракт. Если стул желтовато-водянистый, это означает, что кишечник не очищен, поэтому не рекомендуется сдавать анализ и продолжать принимать слабительное до тех пор, пока не выйдет водянистый стул, а затем снова сдать анализ. Колоноскопию должен проводить профессиональный врач.