Побочные эффекты капецитабина проявляются в основном в пищеварительной системе и изменениях слизистой оболочки кожи. В пищеварительной системе основными побочными эффектами являются обратимые желудочно-кишечные реакции, включая диарею, неоформленный стул, увеличение частоты опорожнения кишечника, тупую боль, растяжение или колики в животе, а также проявления гастроэнтерита, такие как потеря аппетита, тошнота и рвота. Изменения слизистой оболочки кожи, клинически известные как синдром «рука-нога», в основном проявляются в виде онемения, тупости, аномальных ощущений, покалывания и боли в руках и ногах, отека кожи, эритемы, шелушения и даже дерматитных изменений, таких как волдыри и пигментация на кончиках пальцев рук и ног. Другие общие побочные реакции включают мукозит, лихорадку, слабость, сонливость, дисфорию, в единичных случаях головную боль, аномальные ощущения, головокружение, бессонницу, сердцебиение, дискомфорт в прекордиальной области, лейкопению и анемию, но ни одна из них не является клинически серьезной.