Иммуногистохимия проводится при доброкачественных опухолях, но относительно редко. Например, в случае липомы иммуногистохимия не требуется, если обычное рутинное патологическое исследование достаточно четкое. Иммуногистохимия проводится, когда обнаружено поражение, а патологический диагноз не очень ясен при обычном ОН-исследовании. Иммуногистохимия — это специфический метод, подобный подбору ключа к замку, для идентификации клеток, из которых происходит поражение, например, веретеноклеточные поражения могут быть различного происхождения, включая жировую ткань, кровеносные сосуды, нервы и интерстициальные поражения. Например, положительный тест CD34 может определить сосудистое происхождение, что считается опухолью сосудистого происхождения; положительный тест SMA — поражение гладкомышечного происхождения, что считается опухолью миогенного происхождения; положительный тест CD117 — поражение мезенхимального происхождения. Таким образом, иммуногистохимия может помочь определить источник, т.е. в пределах доброкачественных поражений, но бывают случаи, когда диагноз не может быть уточнен обычным исследованием HE, и иммуногистохимия все равно необходима для уточнения диагноза. Кроме того, Ki-67 — это индекс пролиферации, который не может помочь определить происхождение поражения, но может сказать, насколько активно поражение, то есть как быстро растут клетки, а также имеет значение для указания степени злокачественности поражения, поэтому иммуногистохимию можно использовать при доброкачественных поражениях.