Кисты перианальной области обычно лечатся как консервативными, так и хирургическими методами. Консервативное лечение обычно применяется при кистах легкой степени, при их первом наблюдении не нужно проводить специальное лечение. Можно использовать примочки с перманганатом калия для уменьшения воспаления и отека, сидячие ванны с теплой водой в течение получаса каждый день, с применением таблеток левофлоксацина для противовоспалительного лечения. В то же время необходимо уделять внимание личной гигиене вокруг заднего прохода, соблюдать чистоту и сухость. Если кисты в заднем проходе увеличиваются в размерах, появляется ощущение спадения заднего прохода, затрудненное прохождение стула с кровотечением и болью, необходимо перейти к хирургическому методу лечения с иссечением и провести операцию по дренированию кисты. После операции необходимо уделять повышенное внимание гигиене раны, чтобы избежать образования анального свища, спровоцированного анальными кистами, своевременно осматривать анальную рану на предмет наличия инфекции и некроза тканей и своевременно проводить санацию до выздоровления.