Разница между дефектами межпредсердной перегородки и вторичными дефектами межпредсердной перегородки заключается главным образом в величине диаметра дефекта и в том, изменяется ли местоположение дефекта. В настоящее время дефекты межпредсердной перегородки и patent foramen ovale считаются врожденными пороками сердца, однако существуют различия в степени и расположении дефектов. Основным звеном патогенеза дефектов межпредсердной перегородки является врожденная гипоплазия межпредсердной перегородки, приводящая к нарушению движения между левым и правым предсердиями, а вторичные дефекты межпредсердной перегородки располагаются за и над коронарным синусом. Дефект атриовентрикулярной перегородки — состояние, при котором предсердная перегородка выделяет две перегородки на 6-7 неделе эмбрионального развития, первая перегородка является первичной, а вторая — вторичной. Неспособность первичной перегородки слиться со вторичной в овальной ямке оставляет небольшое отверстие, называемое patent foramen ovale. Размер дефекта обычно небольшой, от одного до двух миллиметров в диаметре, в то время как дефекты межпредсердной перегородки обычно больше, до семи-восьми миллиметров в диаметре. Расположение дефекта межпредсердной перегородки обычно изменчиво, в то время как расположение patent foramen ovale относительно фиксировано. Если поставлен диагноз patent foramen ovale или вторичный дефект межпредсердной перегородки, то пациенту рекомендуется агрессивное лечение у врача.