Гастроскопию и колоноскопию в одно и то же время лучше проводить перед колоноскопией. При гастроскопии исследуются поражения слизистой оболочки верхних отделов желудочно-кишечного тракта (включая пищевод, желудок и двенадцатиперстную кишку). Гастроскопия проводится в нижнем отделе желудочно-кишечного тракта (включая толстую и прямую кишку), так что это исследование двух разных мест. Гастроскопия обычно проводится натощак, в то время как для колоноскопии требуется клизма или прием препаратов для очищения кишечника, например, дисперсии полиэтиленгликоля. Сначала пациент проходит гастроскопию рано утром, не принимая пищи, а за гастроскопией может последовать осмотр кишечника. Пациентам рекомендуется не принимать самостоятельного решения о порядке проведения гастроэнтероскопии, а обратиться к врачу, который проведет комплексный анализ для уточнения порядка проведения гастроскопии и энтероскопии.