При отсутствии симптомов инфекцию Mycoplasma genitalium можно пока не лечить, достаточно регулярного осмотра; при наличии явных признаков и симптомов ее можно лечить чувствительными антибиотиками.
Для микоплазм в мочеполовом тракте характерен феномен колонизации, то есть у многих микоплазмоположительных людей отсутствуют симптомы и признаки, только для микоплазмоносителей бессимптомно, в основном это инфекция Mycoplasma hyopneumoniae. Если и у мужа, и у жены нет симптомов, связанных с инфекциями мочеполовых путей, а положительными являются только результаты анализа на Mycoplasma, то считается, что это носительство, и пока лечение не требуется, но необходим регулярный контроль.
При появлении симптомов и диагностировании микоплазменного уретрита, цервицита, воспалительного заболевания органов малого таза и т.д. рекомендуется совместное лечение мужа и жены, при этом в лечении часто используются макролидные антибиотики, такие как азитромицин, эритромицин, рокситромицин и т.д. Как правило, клиническое лечение также основывается на тесте на чувствительность к препаратам, чтобы выявить у пациента, зараженного микоплазмой, чувствительность к антибиотикам для лечения, на период лечения запрещаются половые контакты.
Лечение Mycoplasma genitalium должно проводиться в обычных больницах, а не заниматься самолечением.