Страх перед крысами в основном лечится клинически путем применения психологических методов лечения, таких как системная десенсибилизирующая терапия или шоковая терапия экспозиции, но клинически в основном используется системная десенсибилизирующая терапия. Шоковая терапия экспозиции иногда предполагает, что пациент внезапно врывается в помещение, содержащее большое количество крыс, что может оказать относительно сильное воздействие на организм пациента. Она не подходит для некоторых пациентов, поскольку они физически не в состоянии ее перенести. При систематической десенсибилизирующей терапии процесс десенсибилизации происходит постепенно и может применяться в больших масштабах. Во время клинического лечения страха перед крысами пациенту можно рассказать о развитии страха перед крысами и основных принципах лечения, установить лестницу сценариев страха перед крысами и проводить десенсибилизацию путем постепенного воздействия на каждую лестницу, в конечном итоге достигая цели лечения. Постепенный процесс имагинального воздействия, воображение крысы в своем воображении, постепенное анксиолитическое лечение, рассматривание фотографий крыс для адаптации и, наконец, встреча с настоящей крысой и ее поглаживание, также могут помочь пациентам постепенно преодолеть страх перед крысами.