Среди злокачественных опухолей прогноз при раке щитовидной железы в целом хороший, при этом многие раковые опухоли щитовидной железы имеют метастазы, а пациенты выживают более 10 лет. В прогнозе участвует множество факторов, таких как возраст, пол, тип патологии, степень поражения, метастазы и хирургический подход, при этом тип патологии является наиболее важным. Девяносто пять процентов пациентов с хорошо дифференцированным раком щитовидной железы выживают в течение длительного периода времени, особенно это касается папиллярных карцином, которые, как правило, имеют хороший биологический профиль и лучший прогноз, но некоторые из них также могут стать недифференцированными карциномами с очень высокой степенью злокачественности, а прогноз для недифференцированных карцином самый неблагоприятный. Чем больше опухоль, тем больше вероятность инфильтрации и тем хуже прогноз. Согласно статистическим данным, наличие или отсутствие метастазов в лимфатических узлах не влияет на выживаемость пациентов, в то время как наличие неконтролируемой первичной опухоли или местного рецидива может увеличить смертность.