Промывание легких, также известное в клинической практике как лаважная терапия, имеет некоторые побочные эффекты. В процессе промывания легких часть активных веществ, выделяемых альвеолярной поверхностью легких, будет уноситься и теряться, но сами легкие будут вырабатывать активные вещества альвеолярной поверхности. С другой стороны, в процессе промывания легких неизбежно возникновение преходящего легкого отека легких, который не влияет на нормальную дыхательную функцию легких в целом, не приводит к значительному снижению функции легких и не вызывает таких симптомов, как нарушение дыхания. В клинической практике очистка легких применяется в основном для лечения силикоза, пневмокониоза и болезни альвеолярного отложения белка, и эффект от нее хороший. В сравнении, хотя очистка легких и имеет перечисленные выше побочные эффекты, преимущества перевешивают недостатки.