Желчный пузырь выполняет функцию концентрации, хранения и выделения желчи, поэтому после холецистэктомии некоторые люди могут испытывать клинический дискомфорт в виде несварения желудка и стеатореи, особенно после приема жирной пищи. У большинства людей компенсаторное расширение желчных протоков имеет аналогичный физиологический эффект, поэтому значительного дискомфорта не возникает. В связи с компенсаторным расширением желчных протоков существует также возможный повышенный риск образования вторичных камней в желчных протоках. Тем не менее, не существует доказательной базы, подтверждающей существующее утверждение об увеличении частоты возникновения колоректального рака после холецистэктомии. У небольшого числа пациентов после холецистэктомии может также развиться постхолецистэктомический синдром, который характеризуется болью в животе, высокой температурой, ознобом, желтухой и так далее. В основном это связано с повреждением желчных протоков во время операции, чрезмерной длиной оставленных кистозных протоков, нарушением функции сфинктера и нарушением перистальтики гастродуоденум, и требует агрессивного симптоматического лечения и, при необходимости, повторной операции.