Таргетные препараты для лечения рака молочной железы имеют очень мало токсических побочных эффектов по сравнению с обычными химиотерапевтическими препаратами. Однако у них есть свои, более распространенные побочные эффекты, такие как серьезные аллергические реакции, кожная сыпь и более легкие желудочно-кишечные реакции. Трастузумаб играет знаковую роль среди таргетных препаратов, хотя при лечении рака молочной железы трастузумаб снижает риск рецидива рака молочной железы, однако препарат обладает кардиотоксичностью. Поэтому во время курса трастузумаба каждые три цикла необходимо проводить УЗИ сердца для оценки фракции выброса. У пациенток, у которых фракция выброса сильно страдает от трастузумаба, препарат может потребоваться отменить или даже не применять пожизненно. Другим относительно распространенным токсическим побочным эффектом трастузумаба является развитие гриппоподобных симптомов, таких как лихорадка и озноб, при первом введении препарата. Однако эта реакция обычно слабо выражена и не требует специального лечения, либо пациент выздоравливает при приеме только обычных анальгетиков и жаропонижающих средств.