Последствиями тонзиллэктомии у детей являются такие состояния, как преходящий иммунодефицит. Долгосрочные последствия в настоящее время являются спорными. Миндалины являются иммунным органом и участвуют в иммунном ответе организма. Удаление миндалин приводит к ослаблению иммунитета и может привести к кратковременному повышению вероятности развития инфекций в организме. Однако с возрастом миндалины постепенно уменьшаются после полового созревания, поэтому вопрос о том, есть ли какой-либо эффект в долгосрочной перспективе, остается спорным. При чрезмерном увеличении миндалин, влияющем на дыхание, рецидивирующем воспалении и отсутствии улучшения после консервативного лечения может быть рекомендовано хирургическое иссечение, поскольку очевидно, что недостатки перевешивают преимущества, но оно должно проводиться профессиональным врачом в больнице, операция должна проводиться после оценки врача, необходимо наблюдать за ходом операции и своевременно устранять дискомфорт.