Вирус Brain B передается через укусы комаров, обладает сильной нейрофагией, инкубационный период составляет 10-15 дней. У большинства пациентов симптомы заболевания слабо выражены или протекают бессимптомно в виде латентной инфекции, и лишь у немногих возникают симптомы со стороны центральной нервной системы, которые проявляются в виде высокой температуры, нарушения сознания, судорог и т.д. Типичные случаи заболевания можно разделить на четыре стадии. Типичные случаи можно разделить на четыре стадии общего течения заболевания, в начальном периоде в основном наблюдается высокая температура, сопровождающаяся тошнотой, рвотой, у некоторых пациентов сонливость, вялость сознания и т.д., течение заболевания 1-3 дня, температура тела может достигать 40 ℃ и более, симптомы постепенно усугубляются, сознание явно нарушается, может наступить кома. В тяжелых случаях происходит поражение паренхимы головного мозга, возникает центральная дыхательная недостаточность. В восстановительном периоде и далее температура тела постепенно снижается, психическая и неврологическая симптоматика постепенно улучшается. В послеоперационном периоде через полгода вновь появляются психоневрологические симптомы, которые проявляются в основном нарушением сознания, слабоумием, афазией, параличами конечностей, эпилепсией и т.д.