Обычно у детей младшего возраста с болезнью Кавасаки проверяются обычные анализы крови, мочи, функции печени и почек. Электрокардиограмма и УЗИ сердца также необходимы, особенно у детей с ранним поражением сердца, чтобы проверить, не повреждены ли клапаны и крупные кровеносные сосуды. Большинство детей с болезнью Кавасаки лечатся на ранних стадиях и не имеют последствий. Однако у некоторых детей из-за тяжелого или отсроченного течения болезни или плохой реакции на лекарства наблюдаются нарушения функции сердца или стеноз артерий.