Корреляция между повышенными значениями щелочной фосфатазы и раком печени отсутствует. Повышенные значения могут наблюдаться при заболеваниях гепатобилиарной системы и костного обмена, а для диагностики рака печени чувствительным и относительно специфичным является альфа-фетопротеин. Щелочная фосфатаза в основном вырабатывается печенью и костями. Она в той или иной степени повышена при таких заболеваниях гепатобилиарной системы, как острый гепатит, цирроз, желчнокаменная болезнь и гепатоцеллюлярная карцинома, однако строгой корреляции между повышенным значением и конкретным заболеванием не существует. Кроме того, щелочная фосфатаза является маркером активной остеогенной деятельности и может быть повышена при гипертиреозе, фиброзном остеите, заживлении переломов и остеогенных опухолях костей. Лучшим маркером для диагностики гепатоцеллюлярной карциномы является альфа-фетопротеин, а альфа-фетопротеин > 400 нг/мл может использоваться как одно из оснований для постановки диагноза гепатоцеллюлярной карциномы на основании исключения других заболеваний. Наличие визуализационных признаков рака печени с альфа-фетопротеином >200 нг/мл в течение 8 недель также должно быть крайне подозрительным в отношении возможности рака печени. Пациентам с повышенной щелочной фосфатазой рекомендуется как можно скорее обратиться в больницу, чтобы выявить причину повышения щелочной фосфатазы и получить целенаправленное лечение.