При медикаментозном аборте в основном используются мифепристон и мизопростол. Принцип действия этих двух препаратов при проведении аборта в основном следующий. Во-первых, мифепристон является антагонистом прогестинов, который антагонизирует прогестерон и делает его неактивным. Для развития женского эмбриона необходим прогестерон, поэтому в отсутствие прогестерона эмбрион постепенно теряет свою активность и погибает. После гибели эмбриона эмбриональные ткани и оболочки постепенно отделяются от стенки матки, и пациентка может испытывать вагинальное кровотечение и боли в животе. Во-вторых, мизопростол, основная функция мизопростола — способствовать сокращению матки, а также размягчать шейку матки. Когда матка сокращается, на нее оказывается давление, способствующее изгнанию эмбриона и мекония. Когда шейка матки размягчена, изгнание эмбриона и мекония происходит более плавно. Поскольку шейка матки в норме закрыта, при расслаблении шейки матки пациентке легче раскрыться и облегчить изгнание тканей из полости матки, тем самым достигая цели медикаментозного аборта.