Клиническая медикаментозная терапия пиелонефрита включает в себя в основном противоинфекционные препараты, а также средства для улучшения симптомов. Пиелонефрит — это инфекционное заболевание, вызванное бактериями и другими патогенными микроорганизмами, и основными средствами лечения являются противоинфекционные препараты, такие как пенициллиновые, цефалоспориновые или хинолоновые антибиотики при бактериальных инфекциях, обычно используются амоксициллин, цефуроксим, левофлоксацин и так далее. Грибковые инфекции приводят к необходимости применения противогрибковых препаратов, таких как итраконазол, вориконазол, флуконазол и так далее. Если у пациента наблюдаются явные симптомы раздражения мочевого пузыря, можно применить бикарбонат натрия, чтобы подщелочить мочу и уменьшить симптомы раздражения мочевого пузыря. Все виды лекарств имеют побочные эффекты, например, пенициллин, цефалоспориновые антибиотики могут вызвать сильную аллергию, хинолоновые антибиотики могут привести к недоразвитию хрящей, поэтому выбор препаратов для лечения пиелонефрита должен подбираться специалистами в соответствии с различными возбудителями болезни пациента и не должен применяться самостоятельно.