Наиболее распространенным риском тромболизиса является посттромболитическое кровотечение, которое может привести к повышению внутричерепного давления и, в тяжелых случаях, к грыже мозга, что приводит к смерти пациента. Тромболизис также может привести к смещению мелких эмболов и рецидиву других очагов церебрального инфаркта у пациента. Тромболизис всегда должен проводиться с учетом противопоказаний к тромболизису. Тромболизис не рекомендуется пациентам с предшествующим внутричерепным кровоизлиянием в анамнезе, а также пациентам с субарахноидальным кровоизлиянием. Пациентам с внутричерепными опухолями или артериовенозными мальформациями, инфарктом мозга или церебральной эмболией также не следует проводить тромболизис, чтобы избежать риска посттромболитического кровоизлияния. Тромболизис с помощью внутривенной урокиназы или альтеплазы должен быть назначен пациенту, и у некоторых пациентов симптомы неврологического дефицита могут значительно улучшиться после успешного тромболизиса.