Комплемент C3 является медиатором воспаления в организме и отвечает за иммунный ответ в организме. Когда вирусы и бактерии заражают организм, организм стимулирует иммунный ответ, чтобы уничтожить эти патогены, и комплемент C3 является одним из медиаторов воспаления, участвующих в уничтожении бактерий и вирусов. Это нормальная физиологическая реакция, которая защищает организм, но аномальная секреция C3 комплемента может привести к развитию таких заболеваний, как C3 комплемент-ассоциированная нефропатия. С3 комплемент может также использоваться в клинических целях для определения активности заболевания, например, при волчаночном нефрите, если С3 комплемент значительно ниже, а осадок значительно выше, считается, что волчанка активна. С3 комплемент может также использоваться для оценки регресса заболевания, например, при остром гломерулонефрите, если обнаруживается, что С3 комплемент постепенно возвращается к норме, это говорит о том, что гломерулонефрит выздоровел.