Общие возбудители инфекций мочевыводящих путей включают две основные группы — грамотрицательные и грамположительные бактерии. Грамотрицательные бактерии в основном включают кишечную палочку, которая составляет около 70% или более возбудителей инфекций мочевыводящих путей человека, а также дополнительные грамотрицательные бактерии, такие как Klebsiella и Aspergillus chimaera. Существует также большая группа грамположительных бактерий, в основном энтерококки. Наиболее распространенными энтерококками при заболеваниях мочевыводящих путей являются Enterococcus faecalis и Enterococcus faecalis, оба из которых могут вызывать серьезные инфекции мочевыводящих путей, иногда даже приводящие к инфекционному шоку.