Клинические различия между тиреоидитом и фарингитом проявляются в основном в следующих трех моментах: во-первых, при тиреоидите, подавляющее большинство из которых являются подострыми, обычно за неделю до этого была вирусная инфекция верхних дыхательных путей, поэтому возбудителем является вирус; фарингит, возбудителем которого могут быть бактерии, вирусы или другие микроорганизмы, или даже вредные промышленные газы. Во-вторых, с точки зрения клинических проявлений, подострый тиреоидит в основном проявляется болью в шее, иногда более интенсивной; фарингит в основном проявляется инфекцией дыхательных путей или кашлем, или даже тошнотой. В-третьих, с точки зрения лечения, лечение подострого тиреоидита обычно требует гормональной терапии, и обычно используемым клиническим препаратом является преднизон; в то время как лечение фарингита в основном заключается в антивирусной, антиинфекционной и антибиотикотерапии, при этом необходимо избегать провоцирующих факторов, например, изолировать от стимуляции вредных газов.