Хирургическое лечение альвеолярного синостоза обычно проводится в пубертатный период развития пациента, в момент первой менструации у девочек и в основном в возрасте 11-12 лет у мальчиков. В этот период рост и развитие пациента ускоряются, и операция альвеолярного синостоза в это время способствует развитию челюстей в дальнейшем. Альвеолярная щель — это перерыв в кости, соединяющей ротовую и носовую полости, и первым этапом лечения является прерывание связи между ртом и носом, а в дальнейшем искусственное создание перегородок между ртом и носом, чтобы четко исключить попадание жидкостей из ротовой полости в носовую через альвеолярную щель. Таким образом, первым этапом операции является разделение мягких тканей, а вторым — костный перерыв, который требует аутогенной костной пластики для восстановления костного соединения, что необходимо для будущего развития верхнечелюстной кости или для будущего ортодонтического восстановления зубного ряда. Таким образом, в хирургии альвеолярной расщелины помимо закрытия мягких тканей используется костный трансплантат.