Длительность излечения болезни Кавасаки у детей младшего возраста в значительной степени зависит от того, насколько своевременно было начато лечение ребенка. Если ребенок получает своевременное лечение в течение десяти дней после начала заболевания, то его состояние обычно полностью нормализуется примерно через месяц, но за ребенком все равно нужно будет наблюдать в течение последующих месяцев, чтобы выяснить, нет ли повреждений сердца. Однако если лечение затягивается и ребенку не оказывается помощь в течение десяти дней, существует риск того, что проблемы с сердцем останутся, например, коронарный стеноз, коронарная аневризма или даже сердечная недостаточность. Для таких детей требуется длительное медикаментозное лечение и регулярное амбулаторное наблюдение.