Безболезненная гастроскопия обычно безболезненна. Она основана на общей гастроскопии, при которой внутривенно вводится доза анестезирующих препаратов, чтобы помочь пациенту войти в седативное, сонное состояние, что позволяет пациенту бессознательно завершить обследование и быстро проснуться после него. Поскольку во время обследования пациент спит, можно избежать механических травм, вызванных бессознательным возбуждением, что особенно подходит для пациентов с нервной и боязливой психикой. Цена безболезненной гастроскопии может быть значительно выше, чем цена обычной гастроскопии, ее нельзя проводить женщинам с анестезией, аллергией, беременным или кормящим женщинам, а также требуется шестичасовое наблюдение после нее во избежание несчастных случаев, связанных с анестезией.