Йодофор не является заменой перманганата калия, который обычно используется при заболеваниях промежности и для дезинфекции погружением, но йодофор не рекомендуется использовать для погружения, поскольку при использовании йодофора для погружения, если концентрация высока или слизистая оболочка кожи человека относительно чувствительна, длительное погружение может вызвать раздражение местной воспалительной раны и привести к побочным реакциям, таким как язва или химический ожог. Это может усугубить болезненное воспаление и даже привести к более серьезному отеку. В случае погружения тканей мочеиспускательного канала или влагалища следует использовать только перманганат калия, йодофор применяется только в качестве местного протирания. Смачивание разбавленным перманганатом калия также следует проводить под наблюдением врача, так как слишком высокая концентрация может вызвать коррозийное повреждение кожи и слизистых оболочек.