Повышение уровня глицил-пролин-дипептидазы обычно вызвано заболеванием печени, поэтому для его снижения необходимо лечить соответствующее заболевание печени. Такие распространенные заболевания печени, как вирусный гепатит, алкогольная болезнь печени, жировая болезнь печени, гепатоцеллюлярная карцинома, обструктивная желтуха и другие, способны вызывать повышение глицил-пролин-дипептидазы. При вирусном гепатите необходима защита печени и противовирусное лечение; при алкогольной болезни печени — отказ от алкоголя и защита печени; при жировой болезни печени — снижение веса, контроль веса и защита печени. Глицилпролиндипептидаза повышена у пациентов с гепатоцеллюлярной карциномой, которую можно лечить с помощью интервенционной терапии, хирургии и пероральных целевых препаратов. Обструктивная желтуха требует хирургического вмешательства или других средств для устранения обструкции, и глицилпролиндипептидаза постепенно придет в норму.