В целом, особых побочных эффектов ЭКО в обычных больницах не имеет. Третье поколение ЭКО, также известное как «преимплантационная генетическая диагностика эмбрионов», именуемая PGD, это технология экстракорпорального оплодотворения, когда оплодотворенная яйцеклетка развивается до стадии 6 ~ 8 клеток, с помощью микроскопической технологии удаляются 1 ~ 2 клетки, используется технология генетического анализа, генетическая диагностика заболеваний, удаление больных эмбрионов, будет нормальный эмбрион пересаживается в материнскую полости матки. ЭКО третьего поколения в основном решает проблему носительства обоими родителями генетических заболеваний, таких как талассемия, хромосомные вариации и другие заболевания, удаляя проблемные эмбрионы и перенося нормальные эмбрионы с помощью генетического тестирования, что значительно снижает шансы потомства страдать от хромосомных или генетических нарушений, а также способно снизить частоту пороков развития плода. Процесс переноса аналогичен процессу ЭКО первого и второго поколения, поэтому особых побочных эффектов ЭКО третьего поколения, как правило, не имеет. Пары, которым необходимо провести ЭКО третьего поколения, должны обратиться в профессиональный центр репродукции и под руководством врача пройти различные обследования и процедуры, чтобы избежать негативных последствий.