Тиреоидит Хашимото и гипертиреоз являются более серьезными заболеваниями по сравнению с первичным гипертиреозом, в основном с точки зрения лечения первичного гипертиреоза, время лечения больше, легко возникают рецидивы, в процессе приема пероральных антитиреоидных препаратов также возможно нарушение функции печени и лейкопения. Многие пациенты с тиреоидитом Хашимото не нуждаются в пероральных препаратах, если у них нет комбинированного гипотиреоза. Некоторые пациенты с первичным гипотиреозом, обусловленным тиреоидитом Хашимото, нуждаются в ежедневной заместительной терапии эвгенолом. Эутирокс относительно безопасен и имеет меньше побочных эффектов. Функцию щитовидной железы следует проверять раз в месяц, а если доза эутирокса подобрана правильно и функция щитовидной железы после этого в норме, то нет необходимости проверять ее каждый день.