Частота плазмообмена зависит от типа заболевания, тяжести болезни и концентрации возбудителя. Например, при синдроме легочного кровотечения-нефрита плазмообмен необходимо проводить один раз в день в течение первой недели, с 1-2 объемами плазмы за обмен. Если на 2-ю неделю болезнь находится в стадии ремиссии, плазмообмен можно проводить через день, чтобы снизить патогенный фактор пациента — антитела против ГБМ — до нормального уровня и облегчить течение болезни. При гематологических заболеваниях, таких как тромботическая тромбоцитопеническая пурпура, плазмообмен рекомендуется проводить один раз в день в течение первой недели, при этом каждый обмен составляет 1-2 объема плазмы до полной ремиссии заболевания.