На ранних стадиях грибковая пневмония может не иметь явных клинических признаков или проявляться лишь слабыми симптомами, такими как кашель и мокрота, а симптомы иногда можно спутать с бронхитом и другими легочными инфекциями. Поскольку грибковая пневмония имеет медленное течение, несоблюдение целенаправленного приема противогрибковых препаратов может привести к появлению у пациентов все более тяжелых клинических симптомов, таких как более интенсивный кашель, лихорадка и одышка. Ранняя диагностика пациентов с грибковой пневмонией имеет большое значение, позволяя подобрать соответствующие противогрибковые препараты и выбрать чувствительную лекарственную терапию на основании результатов бактериального посева и лекарственной чувствительности грибка. Пациенты, длительно принимающие антибиотики и глюкокортикоиды, должны быть предупреждены о развитии грибковой пневмонии или других грибковых инфекционных заболеваний.