Аутоиммунный гепатит теоретически неизлечим, так как он вызван аутоиммунной дисфункцией, вызывающей повреждение собственных клеток печени, поэтому его лечат гормонами и иммуносупрессивными препаратами в течение длительного времени. Конечно, по мере улучшения лечения и снижения титра аутоантител количество гормонов и иммунодепрессантов будет постепенно уменьшаться. Как правило, в первый год у пациентов с аутоиммунным гепатитом больше пункций печени, а дозировка гормонов и иммунодепрессантов выше. Аутоиммунный гепатит не является чисто инвазивным заболеванием печени, но часто ассоциируется с системной красной волчанкой и ревматоидным артритом.