У пациентов с туберкулезом мокрота, взятая из дыхательных путей, отрицательна на Mycobacterium tuberculosis, которая не обнаруживается, но когда мокрота берется повторно и культура оказывается положительной на Mycobacterium tuberculosis, она все равно оказывается заразной. В основном это связано с тем, что количество Mycobacterium tuberculosis в мокроте относительно невелико, а концентрация низкая, что не может быть обнаружено простым поиском кислотоустойчивых микобактерий в мокроте. Наиболее надежным доказательством инфицированности является наличие Mycobacterium tuberculosis в мокроте, которую можно обнаружить с помощью культуры. В этом случае пациент способен передавать инфекцию здоровым людям через дыхательные пути и капельным путем, поэтому изоляция все равно необходима.