Снижение химеризма В-клеток костного мозга обычно связано с иммунным отторжением, а также может быть следствием рецидива заболевания. Однако в клинике обычно проверяют только общий клеточный химеризм костного мозга и реже — только В-клеточный химеризм. Как правило, иммунная система организма распознает несамостоятельные компоненты и атакует их, формируя реакцию отторжения. При трансплантации костного мозга, если донор и реципиент состоят в родстве, отторжение будет слабее, но если донор и реципиент не состоят в родстве, отторжение может быть более сильным. После трансплантации костного мозга, если химеризм В-клеток костного мозга снижается, что свидетельствует о том, что иммунный эффект клеток реципиента сильнее, а иммунный эффект клеток донора слабее, доза иммунодепрессантов, таких как такролимус, может быть снижена, чтобы ослабить подавляющее действие на иммунный эффект клеток донора. Кроме того, если химеризм донорских клеток снижается после трансплантации у пациентов с острым лейкозом или миелодиспластическими синдромами, это может быть связано с рецидивом заболевания, и может быть показано целенаправленное лечение, такое как инфузия лимфоцитов от первоначального донора. В случае снижения химеризма В-клеток костного мозга рекомендуется стандартизировать лечение под руководством врача, чтобы избежать затягивания заболевания. Кроме того, вышеперечисленные препараты также должны применяться под руководством врача.