Гипотиреоз, вызванный аутоиммунным тиреоидитом и хирургической резекцией, как правило, неизлечим и требует пожизненного приема лекарств; гипотиреоз, вызванный подострым тиреоидитом, может быть вылечен. К причинам гипотиреоза относятся аутоиммунный тиреоидит (тиреоидит Хашимото, атрофический тиреоидит и т. д.), хирургическая операция на щитовидной железе или лечение радиоактивным йодом, приведшее к разрушению щитовидной железы, врожденный гипотиреоз и т. д. Гипотиреоз, вызванный вышеперечисленными причинами, обычно не может быть полностью излечен и требует пожизненного лечения таблетками левотироксина натрия, но прогноз лучше после стандартизированного лечения. Временный гипотиреоз, вызванный подострым тиреоидитом и передозировкой антитиреоидных препаратов, поддается лечению. Подострый тиреоидит является самоограничивающимся заболеванием, развитие болезни до определенной стадии может восстановиться самостоятельно, может использоваться только симптоматическое лечение, например, при болевых симптомах можно использовать ибупрофен от боли, при симптомах использования нестероидных противовоспалительных препаратов лечение не очень хорошее, можно использовать преднизон и другие препараты, но у небольшого количества пациентов может развиться постоянный гипотиреоз. Гипертиреоз также может быть вызван передозировкой антитиреоидных препаратов, таких как пропилтиоурацил, во время лечения, которое может быть восстановлено путем уменьшения или прекращения приема препарата. Пациенты с диагнозом «гипотиреоз» должны активно сотрудничать с врачами, что поможет улучшить их прогноз.