Дегенеративные заболевания обычно связаны с уменьшением количества паренхимальных клеток или уменьшением размеров и атрофией тканей и органов, которые развивались нормально, в мышцах, печени и надпочечниках, а также в некоторых нервных клетках. К ним относятся физиологическая атрофия, которая происходит по мере старения организма, атрофия многих органов и тканей, включая мышцы и тимус в период полового созревания и репродуктивную систему после менопаузы, и атрофия от неупотребления, которая возникает при снижении нагрузки на органы и ткани в течение длительного периода времени и при их неправильном функционировании, например, атрофия мышц у людей, ведущих сидячий образ жизни. Существуют также эндокринные атрофии, такие как атрофия надпочечников при гипофизарной ишемии, и старение мозга и сердца, при котором происходит атрофия нервных клеток и клеток сердечной мышцы.