Наиболее важным фактором, влияющим на прогноз рака почки, является патологическая стадия. Кроме того, такие факторы, как гистологическая градация, оценка поведенческого статуса пациента, симптомы, наличие некроза тканей в опухоли, а также отклонения и изменения некоторых биохимических показателей также связаны с прогнозом рака почки. Ранее считалось, что прогноз рака почки связан с гистологическим типом, при этом аденокарцинома почечного сосочка и подозрительная клеточная карцинома имеют лучший прогноз, чем чистоклеточная карцинома; аденокарцинома почечного сосочка I типа имеет лучший прогноз, чем II тип; а карцинома собирательного протока имеет худший прогноз, чем чистоклеточная карцинома. Однако некоторые исследования показали, что гистологические подтипы не являются независимыми прогностическими факторами по сравнению со стадией TNM, градацией рака и баллом физического статуса, и нет существенной разницы в прогнозе между подтипами при одинаковой стадии и градации опухоли. Однако частота ответа на цитокиновую терапию варьировалась в зависимости от гистологического типа мРКЦ, при этом у пациентов с ясноклеточным типом карциномы частота ответа составляла приблизительно 10-20%, в то время как почечная папиллярная карцинома и подозрительная клеточная карцинома плохо поддавались лечению цитокинами.