В зависимости от тяжести заболевания туберкулез с множественной лекарственной устойчивостью может длиться от нескольких месяцев до нескольких лет без лечения. При тяжелом течении заболевания с тяжелыми инфекциями и дыхательной недостаточностью туберкулез с множественной лекарственной устойчивостью без лечения может привести к смерти всего за один месяц. Если поражения небольшие и прогрессируют медленно, то выживаемость может достигать нескольких лет. Некоторые пациенты с туберкулезом с множественной лекарственной устойчивостью могут быть излечены при регулярном лечении, которое требует комбинации нескольких противотуберкулезных препаратов в зависимости от лекарственной чувствительности инфицирующих туберкулез бактерий. Пациенты с туберкулезом с множественной лекарственной устойчивостью могут иметь более длительный период лечения и более высокую стоимость лечения, но если они смогут придерживаться лечения, то большинство пациентов все же смогут достичь лучшего результата.