Клинически, в зависимости от инвазии печеночной артерии и воротной вены, течение холангиокарциномы можно разделить на 4 стадии: I стадия: опухоль ограничена желчным протоком без инвазии воротной вены и печеночной артерии; II стадия: опухоль односторонне вовлекает воротную вену и печеночную артерию; IIIa стадия: опухоль вовлекает одну сторону печеночной артерии и бифуркацию воротной вены; IIIb стадия: опухоль вовлекает одну сторону воротной вены и печеночной артерии; IV стадия: опухоль вовлекает печеночную артерию и бифуркацию воротной вены.