Раствор бензалкония хлорида является одним из дезинфицирующих растворов, который убивает большинство вирусов, бактерий и других микроорганизмов, а используемая концентрация зависит от ситуации, в которой он применяется. Если концентрация составляет 0,1%, то он обычно используется для дезинфекции слизистых оболочек кожи, где нет повреждения кожи, а также для дезинфекции хирургического персонала перед операцией при проведении хирургических операций, а также для дезинфекции и консервации хирургических инструментов с использованием концентрации 0,1%. В качестве альтернативы, для дезинфекции травматических ран используется немного меньшая концентрация, например, 0,01%. Если он используется для очистки мочевого пузыря, уретры или глубоких ран, концентрация должна быть еще ниже, она должна составлять 0,005%, чтобы не повредить слизистую оболочку глубоких слоев кожи.