На ранних стадиях заболевания пищеварительного тракта обычно проводится эндоскопическое исследование, поскольку ранние поражения находятся как в слизистой, так и в подслизистой оболочке и не могут быть обнаружены с помощью КТ. Когда образование вырастает до определенной степени, поражение можно визуализировать с помощью КТ внутри и снаружи кишечника. Если образование растет наружу и не видно при эндоскопии, КТ может четко визуализировать трехмерную структуру образования и окружающие взаимоотношения для дальнейшей дифференциации. На средних и поздних стадиях образований пищеварительного тракта КТ (особенно усиленная КТ) может уточнить расположение, размер и связь поражения с окружающей областью, а также наличие увеличенных лимфатических узлов, что позволяет поставить четкий диагноз.