При печеночном расщеплении лимонной кислоты в конечном итоге образуются вода, углекислый газ и энергия. Лимонная кислота участвует в процессе цикла трикарбоновых кислот в печени человека. Часть лимонной кислоты поступает в организм через пищеварительный тракт, а часть образуется в результате конденсации ацетил-КоА и оксалоацетата, которая катализируется различными ферментами в печени и подвергается реакции распада, при этом часть энергии высвобождается в процессе распада. Лимонная кислота подвергается декарбоксилированию в печени, сначала образуя оксалоацетат, а затем под действием катализирующих ферментов распадается на воду и углекислый газ. Углекислый газ обычно выводится с током крови через воздухообмен в легких, а часть воды может быть поглощена и использована организмом, а часть выведена с мочой и потом, а энергия обычно расходуется на клеточную деятельность гепатоцитов.