Прогрессирующая стадия СПИДа, как правило, снижает продолжительность жизни, но ее можно увеличить, если пациенты регулярно проходят лечение. На поздних стадиях неконтролируемого СПИДа возникает ряд осложнений, в основном оппортунистические инфекции, такие как пневмоцистная пневмония, токсоплазмоз и диссеминированная инфекция Mycobacterium avium. Существует также ряд заболеваний, свидетельствующих о СПИДе, включая некоторые злокачественные опухоли (саркома Капоши, лимфома), а также заболевания, причина которых неизвестна и которые, как считается, связаны с неконтролируемой ВИЧ-инфекцией, например истощение или энцефалопатия. Вышеперечисленные осложнения могут серьезно повлиять на продолжительность жизни людей, живущих с ВИЧ, поэтому раннее вмешательство после постановки диагноза ВИЧ очень важно, а комбинированная антиретровирусная терапия (АРТ) произвела революцию в лечении. Вылечить ВИЧ-инфекцию невозможно, но естественное течение болезни радикально изменилось, и ожидается, что лечение ВИЧ-инфицированных пациентов без других серьезных сопутствующих заболеваний до начала тяжелой иммуносупрессии позволит приблизить продолжительность жизни к показателям общей популяции.