Лечение синусовой аритмии требует этиологического лечения и, кроме того, применения антиаритмических препаратов. При синусовой аритмии антиаритмическим препаратом выбора является препарат класса IB — пропафенон, также доступен препарат класса III — амиодарон. Однако в целом амиодарон III класса более эффективен, чем пропафенон IB класса. Применение амиодарона может эффективно увеличить процент излечения пациентов, улучшить их состояние, уменьшить их страдания, а также снизить вероятность побочных реакций, и может рассматриваться для клинического применения. Синусовая аритмия характеризуется быстрым началом в патологическом состоянии и является крайне опасной, проявляясь в виде паники, учащенного сердцебиения и обморока. Синусовая аритмия может также сопровождаться вторичной ишемией миокарда или даже инфарктом миокарда, что приводит к плохому прогнозу. У пациентов с синусовой аритмией повышается потребление кислорода миокардом, что приводит к уменьшению наполнения желудочков и в конечном итоге к развитию таких состояний, как сократительная сердечная недостаточность.