Восстановление черепной коробки — рутинная нейрохирургическая процедура, и в настоящее время техника ее проведения более отработана, поэтому в принципе риск невелик, но все же существует риск анестезии, повреждения сосудов, нервов, инфекции и отторжения во время процедуры. Восстановление костей черепа относится к операциям второго уровня по классификации нейрохирургической хирургии и является менее сложной процедурой. Однако существует риск анестезии, поскольку операция требует общей анестезии. Кроме того, из-за большого хирургического разреза существует большая вероятность повреждения кровеносных сосудов и нервов. Специальный материал, используемый для восстановления черепа, и возможность отторжения этого материала организмом также являются хирургическим риском. При наличии дефекта черепа рекомендуется проводить восстановление костей черепа как можно раньше, при условии, что исходное заболевание хорошо восстановилось. Раннее восстановление костей черепа способствует восстановлению нормального внутричерепного кровотока и восстановлению неврологических функций, что улучшает прогноз пациента.